Lompat ke konten Lompat ke sidebar Lompat ke footer

Bagaimana Varian SARS-CoV-2 Mengorbankan Pengikatan Ketat untuk Penghindaran Antibodi

Varian SARS-CoV-2 yang sangat menular yang baru-baru ini muncul di Afrika Selatan, yang dikenal sebagai B.1.351, membuat para ilmuwan bertanya-tanya bagaimana vaksin dan terapi COVID-19 yang ada dapat ditingkatkan untuk memastikan perlindungan yang kuat. Sekarang, para peneliti yang melaporkan di ACS ' Journal of Medicinal Chemistry telah menggunakan pemodelan komputer untuk mengungkapkan bahwa salah satu dari tiga mutasi yang membuat varian B.1.351 berbeda dari SARS-CoV-2 asli mengurangi ikatan virus pada sel manusia - tetapi berpotensi. memungkinkannya untuk melepaskan diri dari beberapa antibodi.

IMAGES

Gambar: image-cdn.medkomtek.com

Sejak SARS-CoV-2 pertama kali terdeteksi pada akhir 2019, beberapa varian baru telah muncul, termasuk dari Inggris, Afrika Selatan, dan Brasil. Karena varian baru tampaknya lebih mudah menular, dan dengan demikian menyebar dengan cepat, banyak orang khawatir bahwa mereka dapat merusak vaksin saat ini, terapi antibodi atau kekebalan alami. Varian B.1.351 mengandung dua mutasi (N501Y dan E484K) yang dapat meningkatkan pengikatan antara reseptor binding domain (RBD) protein lonjakan virus corona dan reseptor ACE2 manusia. Namun, mutasi ketiga (K417N; mutasi lisin ke asparagin pada posisi 417) membingungkan karena menghilangkan interaksi yang menguntungkan antara RBD dan ACE2. Karena itu,Binquan Luan dan Tien Huynh dari IBM Research ingin menyelidiki manfaat potensial dari mutasi K417N yang dapat menyebabkan virus corona berkembang di sepanjang jalur ini.

Para peneliti menggunakan simulasi dinamika molekuler untuk menganalisis konsekuensi mutasi K417N pada varian B.1.351. Pertama, mereka memodelkan pengikatan antara RBD SARS-CoV-2 asli dan ACE2, dan antara RBD dan CB6, yang merupakan antibodi penetralisir SARS-CoV-2 yang diisolasi dari pasien COVID-19 yang pulih. Mereka menemukan bahwa asam amino asli, lisin, pada posisi 417 di RBD berinteraksi lebih kuat dengan CB6 dibandingkan dengan ACE2, konsisten dengan kemanjuran terapeutik antibodi pada model hewan. Kemudian, tim memodelkan pengikatan dengan varian K417N, yang mengubah lisin itu menjadi asparagin. Meskipun mutasi ini mengurangi kekuatan pengikatan antara RBD dan ACE2, mutasi ini menurunkan pengikatan RBD ke CB6 dan beberapa antibodi manusia lainnya ke tingkat yang jauh lebih besar. Jadi, varian B.1.351 tampaknya telah mengorbankan pengikatan ketat ke ACE2 di situs ini untuk kemampuan menghindari sistem kekebalan. Informasi ini terbukti berguna bagi para ilmuwan karena mereka bekerja untuk meningkatkan perlindungan vaksin dan terapi saat ini, kata para peneliti.

Powered By NagaNews.Net